В недалеком будущем человечество достигло значительных успехов в области генетики, что позволило создать новую категорию людей — Координаторов. Эти обладатели измененного генома превосходят обычных людей по всем основным параметрам: они умнее, сильнее и быстрее. Однако это нововведение не было воспринято с восторгом; многие стали бояться и ненавидеть тех, кто был так сильно отличен от них. Вскоре разразилась жестокая война между двумя сторонами: Координаторами и Натуралами — людьми, сохранившими свои природные способности. В этот конфликт неожиданно оказывается втянут подросток по имени Кира Ямато. Его жизнь меняется, когда он принимает решение стать пилотом боевого робота GUNDAM, чтобы защитить своих друзей и близких. Для Кира вопрос генетической принадлежности теряет значение — он, как истинный Координатор, игнорирует разделение и сражается за тех, кого любит, а не за свою сторону. Его цель заключается не в том, чтобы одержать победу в войне, а в том, чтобы остановить насилие и ненависть, разрушение и страдания. С каждым сражением Кира все больше осознает, как глубоко и болезненно проходят раны этого конфликта. Его идеалы о мире и понимании становятся испытанием, когда он сталкивается с врагами, которые видят в нем лишь представителя своего племени. Сложные отношения, внутренние противоречия и страдания окружающих заставляют юного пилота задуматься о смысле борьбы и о том, что значит быть человеком в мире, наполненном предрассудками. Путешествуя по пути самооткрытия, Кира борется не только с внешними врагами, но и с собственными страхами и сомнениями. Он понимает, что под гневом и ненавистью скрыты истинные причины конфликтов, и это знание может стать ключом к преодолению разобщенности между Координаторами и Натуралами. Его противостояние станет не только физическим, но и духовным, когда он попытается найти общий язык между двумя мирами и привести их к долгожданному миру. Таким образом, "Мобильный воин Гандам: Поколение" — это история о борьбе за единство и понимание, о личных жертвах ради мира и о том, что истина и человечность не зависят от генетической предрасположенности.